Vườn Sao Băng (Bản Nhật) (Phần 2) tiếp tục câu chuyện về Makino Tsukushi, một học sinh nghèo nhưng có trái tim trong sáng và can đảm. Cô là học sinh duy nhất không thuộc tầng lớp giàu có tại học viện Eitoku, nơi đào tạo những thế hệ lãnh đạo tương lai của Nhật Bản. Tại đây, cô gặp Flower 4 (F4), một nhóm bốn chàng trai quyền lực và giàu có đến từ các gia đình danh giá.
Họ là Domyoji Tsukasa, người thừa kế Tập đoàn Tài chính Toàn cầu Domyoji; Hanazawa Rui, con trai của một ông chủ công ty lớn; Nishikado Sojiro, một tay chơi có tiếng và người thừa kế một đạo quán; và Mimasaka Akira, người có liên quan đến thế giới ngầm. Bốn chàng trai này thống trị ngôi trường và đặt ra quy tắc riêng. Bất kỳ học sinh nào làm trái ý họ sẽ nhận một thông báo màu đỏ, bị cả trường tẩy chay và cuối cùng phải rời trường.
Makino Tsukushi sớm trở thành tâm điểm của sự chú ý khi cô từ chối lời đề nghị của Domyoji Tsukasa. Từ đó, cuộc sống của cô bị thay đổi hoàn toàn khi cô liên tục vướng vào những tình huống khó khăn do F4 tạo ra. Tuy nhiên, qua những thử thách, cô cũng dần nhận được sự quan tâm và tình cảm từ những người xung quanh, đặc biệt là từ chính Domyoji Tsukasa.
Câu chuyện của Vườn Sao Băng (Bản Nhật) (Phần 2) xoay quanh mối quan hệ phức tạp giữa các nhân vật, tình yêu, sự phản bội và lòng trung thành. Makino Tsukushi liệu có thể vượt qua những khó khăn và tìm được hạnh phúc của mình trong môi trường khắc nghiệt này?